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巖扇貝原種和繁育后代腸道和內(nèi)臟團(tuán)細(xì)菌多樣性分析

鄒建威; 曹善茂; 李曉雨; 劉鋼; 王堯; 王斌 大連海洋大學(xué)遼寧省海洋生物資源恢復(fù)與生境修復(fù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 遼寧大連116023
  • 巖扇貝
  • 腸道菌群
  • 內(nèi)臟團(tuán)菌群
  • 多樣性

摘要:為研究巖扇貝Crassadoma gigantean的生物學(xué)特性和消化代謝機(jī)能,采用傳統(tǒng)培養(yǎng)方法分離培養(yǎng)加拿大原種巖扇貝內(nèi)臟團(tuán)(JN)和腸道(JC)及中國(guó)育種得到的子一代巖扇貝內(nèi)臟團(tuán)(YN)和腸道(YC)4種樣品中的細(xì)菌,測(cè)定分離到的可培養(yǎng)細(xì)菌的16S rRNA基因并確定其分類地位;提取上述樣品中的總DNA,運(yùn)用Ion S5TMXL高通量測(cè)序平臺(tái),對(duì)樣品中細(xì)菌群落多樣性進(jìn)行分析。結(jié)果表明:用傳統(tǒng)方法獲得可培養(yǎng)菌株83株,選取代表菌31株測(cè)序并比對(duì),其分別屬于嗜冷桿菌屬Psychrobacter、動(dòng)性球菌屬Planococcus、弧菌屬Vibrio、假單胞菌屬Pseudomonas、假交替單胞菌屬Pseudoalteromonas、芽孢桿菌屬Bacillus、庫(kù)克菌屬Kocuria和副球菌屬Paracoccus;高通量測(cè)序結(jié)果顯示,4種樣品中有效序列群落結(jié)構(gòu)可分為9個(gè)門,分別為變形菌門Proteobacteria、異常球菌-棲熱菌門Deinococcus-Thermus、擬桿菌門Bacteroidetes、厚壁菌門Firmicutes、藍(lán)細(xì)菌門Cyanobacteria、軟壁菌門Tenericutes、放線菌門Actinobacteria、浮霉菌門Planctomycetes和疣微菌門Verrucomicrobia;加拿大原種巖扇貝腸道樣品中的優(yōu)勢(shì)菌門為變形菌門(占80%),次優(yōu)勢(shì)菌門為擬桿菌門(占15%),內(nèi)臟團(tuán)樣品中的優(yōu)勢(shì)菌門為變形菌門(占52%),次優(yōu)勢(shì)門為擬桿菌門(占18%);中國(guó)育種得到的子一代巖扇貝腸道樣品中的優(yōu)勢(shì)菌門為變形菌門(占61%),次優(yōu)勢(shì)菌門為擬桿菌門(占26%),內(nèi)臟團(tuán)樣品中的優(yōu)勢(shì)菌門為變形菌門(占73%),次優(yōu)勢(shì)菌門為擬桿菌門(占17%)。研究表明,巖扇貝的腸道和內(nèi)臟團(tuán)微生物具有豐富的多樣性,加拿大原種巖扇貝和國(guó)內(nèi)子一代巖扇貝的腸道和內(nèi)臟團(tuán)細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)存在一定差異。

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