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豬德爾塔冠狀病毒Taq Man熒光定量PCR檢測方法的建立及應用

江珊; 李富強; 李秀麗; 王利麗; 鄭麗; 張莉; 路超; 鄢明華 天津市畜牧獸醫研究所; 天津300381; 農業農村部獸用藥物與診斷技術天津科學觀測實驗站; 天津300381; 天津市畜禽健康養殖技術工程中心; 天津300381
  • 豬德爾塔冠狀病毒
  • m基因
  • taq
  • man探針
  • 熒光定量pcr

摘要:為建立一種快速、靈敏、準確的豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV)分子檢測方法,根據PDCoV M基因的保守序列設計并合成引物和探針,建立了PDCoV M基因Taq Man熒光定量PCR檢測方法。結果表明,該方法標準曲線具有良好的線性關系,相關系數為0.998;敏感性好,最低可檢測到10 copies/μL的PDCoV M基因標準品;特異性試驗結果顯示,該方法與豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)、豬輪狀病毒(PoRV)、豬瘟病毒(CSFV)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬偽狂犬病病毒(PRV)、豬圓環病毒2型(PCV2)、豬細小病毒(PPV)及大腸埃希菌K88菌株均無交叉反應;重復性試驗變異系數低于2%,表明重復性良好。對121份臨床樣本進行檢測,陽性檢出率為53.7%(65/121),隨機選擇10份陽性樣品的擴增產物進行測序分析,進一步證實擴增產物中含有PDCoV。該方法具有敏感性高、特異性強、用時短和高通量等特點,適用于PDCoV的定量檢測與分子流行病學調查,為PDCoV的準確定量及進一步研究奠定了基礎。

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