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草莓FvARF5基因的克隆、生物信息學(xué)及表達分析

蘇麗艷 西安文理學(xué)院生物與環(huán)境工程學(xué)院秦嶺野生觀賞植物研究中心; 陜西西安710065
  • 草莓
  • fvarf5
  • 生長素
  • 基因克隆

摘要:生長素響應(yīng)因子ARF是一類新的轉(zhuǎn)錄因子,通過激活或抑制生長素響應(yīng)基因的表達調(diào)控植物的生長發(fā)育過程。為解析草莓生長素響應(yīng)因子FvARF5在草莓形成過程中的功能,以草莓為試驗材料,克隆了FvARF5基因并進行了生物信息學(xué)分析,利用qPCR分析了FvARF5在草莓不同組織及植物激素處理下的表達模式。結(jié)果表明,FvARF5基因開放閱讀框為2745bp,編碼914個氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為100.65ku,等電點為5.25。多序列比對和系統(tǒng)進化樹分析表明,FvARF5基因具有保守的B3DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域和生長素響應(yīng)因子保守結(jié)構(gòu)域,與薔薇科月季ARF5基因的進化關(guān)系最近,相似度達95%。亞細胞定位預(yù)測分析表明,FvARF5蛋白定位于細胞核中。啟動子分析顯示,FvARF5基因具有多樣化的激素應(yīng)答元件。qPCR結(jié)果表明,FvARF5存在組織表達差異,在莖和綠果中表達量較高。另外,FvARF5基因表達受到生長素和赤霉素的誘導(dǎo),初步推測該基因可能參與了生長素和赤霉素調(diào)控草莓果實的形成過程。為進一步研究FvARF5基因的功能奠定基礎(chǔ)。

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