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北京鴨BNIP3L基因CDS區克隆及序列分析

甘偉; 任小春; 任小松 四川省達州市農業科學研究院; 四川達州635000
  • 北京鴨
  • bnip3l
  • 基因克隆
  • 序列分析

摘要:BNIP3L定位于線粒體,廣泛分布于各個組織中,具有促凋亡的作用。根據NCBI上鴨BNIP3L基因預測序列設計引物,利用PCR技術,對鴨BNIP3L基因CDS區序列進行克隆。結果表明:擴增出BNIP3L基因的CDS區序列全長為543bp,編碼180個氨基酸,相對分子質量為19.52ku,理論等電點為6.334。另外,該氨基酸序列存在典型的3個低密度區域和1個跨膜結構域。經比對分析發現鴨的BNIP3L基因具有特有的保守序列,而且與鳥類的BNIP3L基因具有較高的相似性,并對其氨基酸序列和蛋白質結構進行了分析,整個多肽鏈中疏水性氨基酸為151個,親水性氨基酸為29個,因此整個多肽鏈應為疏水性。其蛋白質二級結構由α-螺旋、β-轉角、延伸鏈和無規則卷曲組成,分別占22.78%、7.22%、17.78%和52.22%。以上數據表明北京鴨 BNIP3L基因CDS區序列與安氏蜂鳥、朱鷯、雞具有較高的一致性,且在物種進化過程中較為保守。

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