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微泡菌ALW1幾丁質酶Chi18A的克隆及信息學分析

李鶴賓; 梁梅芳; 陳仲巍; 姜澤東; 倪輝; 朱艷冰 廈門醫學院藥學系; 福建廈門361023; 集美大學食品與生物工程學院; 福建廈門361021
  • 微泡菌
  • 幾丁質酶
  • 克隆
  • 信息學分析

摘要:以微泡菌(Microbulbifersp.)ALW1的基因組為模板,利用幾丁質酶基因的特異性引物進行PCR擴增,然后將產物插入到pMD18-T載體后進行DNA序列測定,并對目的基因編碼的蛋白質序列進行信息學分析。結果顯示,克隆的目的基因大小為1644bp,預測編碼含有547個氨基酸殘基的蛋白質。該蛋白質序列與其他菌株來源的幾丁質酶序列具有70%左右的相似性,表明預測目的基因編碼幾丁質酶。該蛋白質具有2個幾丁質結合結構域和1個GH18家族酶的催化結構域,屬于糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)家族18,命名為幾丁質酶Chi18A。模擬的三維結構顯示,Chi18A含有(βα)8桶狀結構。

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集美大學學報·自然科學版

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