摘要：中國經濟體制改革和社會轉型伴隨著科技創新體系制度基礎的變革,探討建國以來,特別是改革開放之后,中國科技創新體系制度基礎變革的歷程、特征及其挑戰,有助于繼承、發揚以往改革實踐的歷史經驗,理解當下中國科技創新體系面臨的挑戰,把握未來中國科技創新體系改革的方向。本文從三個階段分析了中國科技創新體系制度基礎形成和變革的歷史,總結了制度基礎變革的特征與實踐經驗,并從防止舊體制復歸、增強探索新道路的能力、全面認識市場體制的深刻內涵和塑造充滿活力的創新生態體系等方面探討了深化改革可能面臨的挑戰。