摘要：[目的]探討RAD-seq技術在中國杜鵑花復雜類群分類與物種界定方面的優勢。[方法]本研究對杜鵑花屬85個種進行了RAD-seq測序,評估了數據的基本特征;同時,以馬纓杜鵑基因組作為參考,獲得高質量SNP位點,并進一步通過ADMIXTURE、PCA、GCTA及FastTree軟件對其進行基因分型、聚類與系統樹構建。[結果]本研究中85份材料比對至馬纓杜鵑的平均比對率87.52%,在參考基因組上的平均覆蓋度為5.21%,最終獲得了620371個SNP位點。基于PCA、Structure聚類及系統發育樹的分析結果,本研究支持目前在亞屬水平(杜鵑亞屬、常綠杜鵑亞屬、馬銀花亞屬、羊躑躅亞屬、映山紅亞屬和長蕊杜鵑亞屬)的形態學分類處理,并突出了鱗片在杜鵑屬植物分類中的重要作用。[結論]RAD-seq數據產生的大量SNP位點可區分杜鵑花亞屬和組內的大部分物種,說明其在復雜類群分類與物種界定方面具有可行性。