摘要：為給染色體片段置換系的快速鑒定提供新的技術手段,用3個以普通小麥品種中國春(Chinese Spring,CS)為背景的野生二粒小麥(TTD140)染色體臂置換系(chromosome arm substitution line,CASL)進行轉錄組測序,并結合SNP分析,獲得純合的SNP,用于鑒定CASL材料中TTD140的置換區段。結果發現,CASL3AL的SNP主要分布在染色體3A的108~750 Mb區段;CASL7BS的SNP分布于染色體7B的0~536 Mb和5A的22~482 Mb區段;CASL4AL的SNP分布比較復雜,除集中在4A的40~745 Mb、7B的0~570 Mb以及5B的410~675 Mb外,還在1A、2A、3A、7A、2B、2D、5D、6D和7D染色體上成簇分布,表明該材料除在預期的染色體4A上保留TTD140的大片段外,還在其他染色體上殘留許多TTD140小片段。通過97對多態性SSR標記驗證CASL3AL的染色體組成,發現84對標記能檢測到TTD帶型,其分布范圍與轉錄組數據鑒定結果基本一致。對SNP富集區域的320 bp PCR產物直接測序,發現CASL3AL與CS之間存在7個SNP位點,但與TTD140以及Zavitan參考序列一致。因此,本研究利用轉錄組測序技術能夠有效鑒定小麥染色體片段置換系材料的染色體組成,且比傳統的分子標記技術準確、方便、快捷。