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桂花SVP同源基因的克隆及序列分析

何國慶; 常鵬杰; 卞賽男 浙江省長興縣永綠林業發展中心; 浙江長興313100; 浙江農林大學風景園林與建筑學院; 浙江臨安311300
  • 桂花
  • svp
  • 基因克隆
  • 序列分析

摘要:試驗以桂花‘日香桂'Osmanthus fragrans cv.rixianggui嫩葉為試驗材料,根據轉錄組數據庫中SVP基因的保守序列信息,通過PCR方法克隆得到日香桂SVP基因,將其命名為QfSVP,運用在線生物信息學分析工具對OfSVP序列進行分析。結果表明:OfSVP基因全長1325bp,開放閱讀框(ORF)為687bp,編碼228個氨基酸。氨基酸序列保守性分析發現,OfSVP所編碼的蛋白中含有MADS-box基因家族特有的K-box區域。通過ProtParam ExPASy在線軟件分析OfSVP蛋白質分子式為C1121H1859N327O364S9,分子量為26030.60Da,理論等電點PI值為5.80。不穩定指數為68.10,屬于不穩定蛋白質。蛋白氨基酸序列比對和系統發育進化分析結果表明OfSVP與油橄欖(Olea europaea)、黃連(Coptis chinensis)和芝麻(Sesamum indicum)的同源性分別達到94%、83%和82%;OfSVP基因的克隆與序列分析對于進一步了解桂花'日香桂'成花機理具有重要意義。

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南方園藝

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