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酒鬼酒發(fā)酵車間空氣源細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育多樣性研究

吳秋蕾; 黎有有; 鄧麗穎; 趙湖; 郝立娟; 樊林; 陳義光; 張麗 吉首大學(xué)生物資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院; 湖南吉首416000; 酒鬼酒股份有限公司; 湖南吉首416000
  • 酒鬼酒發(fā)酵車間
  • 空氣微生物
  • 16s
  • rrna基因
  • 系統(tǒng)發(fā)育分析

摘要:本研究采用空氣自然沉降法和純培養(yǎng)法從酒鬼酒發(fā)酵車間收集分離空氣中可培養(yǎng)細(xì)菌(含放線菌),運(yùn)用基于16S rRNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析法對(duì)菌株進(jìn)行多樣性研究。用添加10%酒鬼酒酒醅浸汁的營養(yǎng)瓊脂、麥芽膏-酵母膏和高氏一號(hào)培養(yǎng)基,從酒鬼酒發(fā)酵車間分離純化到127株細(xì)菌菌株。根據(jù)形態(tài)觀察和部分生理生化實(shí)驗(yàn)去冗余,選取72株具有代表性的菌株,對(duì)其進(jìn)行基于16S r RNA基因序列的系統(tǒng)發(fā)育多樣性分析。結(jié)果表明,這些分離菌株具有較高的類群多樣性,分屬于細(xì)菌域的4個(gè)門(Actinobacteria,Deinococcus-Thermus,Firmicutes,Proteobacteria)的17個(gè)科(Aurantimonadaceae,Bacillaceae,Bacillales FamilyⅫ,Corynebacteriaceae,Deinococcaceae,Intrasporangiaceae,Microbacteriaceae,Moraxellaceae,Nocardiaceae,Planococcaceae,Propionibacteriaceae,Pseudomonadaceae,Rhizobiaceae,Rhodobacteraceae,Sphingomonadaceae,Staphylococcaceae,Xanthomonadaceae)的24個(gè)屬(Acinetobacter,Agrococcus,Arsenicicoccus,Arthrobacter,Aurantimonas,Bacillus,Corynebacterium,Deinococcus,Exiguobacterium,Janibacter,Kocuria,Luteococcus,Microbacterium,Micrococcus,Paracoccus,Pararhodobacter,Pseudomonas,Rhodococcus,Shinella,Sphingomonas,Sporosarcina,Staphylococcus,Virgibacillus,Xanthomonas)。優(yōu)勢(shì)類群為Actinobacteria門(34株,47.22%),其中Micrococcaceae為優(yōu)勢(shì)科,含15株菌株;其次是Proteobacteria門(24株,33.33%)和Firmicutes門(11株,15.28%),還分離到3株屬于分類名稱尚未確定且目前根據(jù)《伯杰氏細(xì)菌手冊(cè)》暫稱為異常球菌-棲熱菌門(Deinococcus-Thermus)的細(xì)菌。這些菌株可分為53個(gè)物種,大部分菌株與其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系最密切的已知物種的典型菌株之間存在一定的遺傳差異(16S rRNA基因序列相似性為96.37%~99.88%)。其中至少有5株(JSM 2215019、JSM 2215034、JSM2215039、JSM 2215042和JSM 2215109)可能代表潛在的新的分類單元(potential new taxa),它們可能分別代表Sphingomonas,Corynebacterium,Arthrobacter,Paracoccus和Deinoc

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