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玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆與生物信息學(xué)分析

康希泉; 亓帥; 臧德奎; 鄭林; 徐宗大; 邢樹(shù)堂; 于曉艷 勝利油田勝大園林工程有限公司; 山東東營(yíng)257000; 山東農(nóng)業(yè)大學(xué); 山東泰安271000; 青州市花卉產(chǎn)業(yè)管理局; 山東青州262500
  • 玫瑰
  • 基因克隆

摘要:為了探明胼胝質(zhì)對(duì)玫瑰授粉親和性的影響,本研究以‘唐紅’玫瑰花柱為試材,采用RT-PCR和RACE方法獲得了玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全長(zhǎng),命名為RrCalS。該基因全長(zhǎng)5742 bp,開(kāi)放閱讀框5295 bp,編碼1764個(gè)氨基酸。推導(dǎo)編碼蛋白的分子量為204.7kD, PI值為9.00,在164-265位具有pfam14288結(jié)構(gòu)域,在869-1642位具有pfam02364保守結(jié)構(gòu)域,屬于葡聚糖合成酶超家族;該蛋白屬于疏水性、非分泌型蛋白,具有16個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,含有32個(gè)Ser磷酸化位點(diǎn)、21個(gè)Thr磷酸化位點(diǎn)、12個(gè)Tyr磷酸化位點(diǎn);該蛋白的α-螺旋占49.49%,無(wú)規(guī)則卷曲占22.68%,β-轉(zhuǎn)角占7.94%;該蛋白與Fragaria vesca等8種植物的Cals氨基酸序列同源性達(dá)73%以上,且它們的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系與傳統(tǒng)分類(lèi)結(jié)果一致。本研究為進(jìn)一步深入研究玫瑰授粉不親和機(jī)理,提高玫瑰育種理論和技術(shù)水平奠定了基礎(chǔ)。

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山東林業(yè)科技

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  • 農(nóng)業(yè) 快捷分類(lèi)
  • 雙月刊 出版周期

主管單位:山東省自然資源廳;主辦單位:山東省林業(yè)科學(xué)研究院;山東林學(xué)會(huì)

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