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基于機器學習的RNA編輯位點預測方法綜述

冷嘉承; 吳凌云 中國科學院數學與系統科學研究院應用數學研究所; 管理、決策與信息系統重點實驗室; 國家數學與交叉科學中心; 北京100190; 中國科學院大學數學科學學院; 北京100049
  • rna編輯
  • 高通量測序
  • 機器學習

摘要:RNA編輯是一個十分重要的生物細胞分子機制。作為轉錄后修飾的一步,它可以增加蛋白質組學多樣性,改變轉錄產物的穩定性,調節基因表達等。RNA編輯失調會導致各種疾病,包括神經疾病和癌癥。在動物中,腺苷到肌苷(A-to-I)的編輯是最普遍的。高通量測序技術的進步大大提高了在全局范圍內檢測和量化RNA編輯的能力,使得RNA編輯的大規模全基因組分析變得可行,產生了一系列基于高通量測序技術的RNA編輯位點預測方法。通過對這些方法進行介紹、總結和分析,為RNA編輯的進一步研究提供一些思路。

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生物信息學

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