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基于遺傳算法預測2D三向的蛋白質結構

夏慧芳; 郭雨珍; 江宏昊 南京航空航天大學理學院數學系; 南京211106
  • 蛋白質結構預測
  • 范德華力勢能
  • 遺傳算法
  • 調整算子

摘要:本文基于范德華力勢能預測2D三向的蛋白質結構。首先,將蛋白質結構預測這一生物問題轉化為數學問題,并建立基于范德華力勢能函數的數學模型。其次,使用遺傳算法對數學模型進行求解,為了提高蛋白質結構預測效率,我們在標準遺傳算法的基礎上引入了調整算子這一概念,改進了遺傳算法。最后,進行數值模擬實驗。實驗的結果表明范德華力勢能函數模型是可行的,同時,和規范遺傳算法相比,改進后的遺傳算法能夠較大幅度提高算法的搜索效率,并且遺傳算法在蛋白質結構預測問題上有巨大潛力。

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生物信息學

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