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馬鈴薯StPSKRs基因的克隆及其亞細(xì)胞定位分析

盧瑤; 胡金雪; 金鑫; 陳越; 陳勤; 盧海彬 西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)學(xué)院/旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 陜西楊陵712100; 西北農(nóng)林科技大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院/旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 陜西楊陵712100
  • 馬鈴薯
  • 植物磺肽素
  • 植物磺肽素受體
  • 生物信息學(xué)
  • 亞細(xì)胞定位

摘要:該研究采用同源克隆與PCR擴(kuò)增方法,從馬鈴薯品種‘Desiree’中克隆植物磺肽素受體基因StPSKR 1和StPSKR 2的全長cDNA,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析及亞細(xì)胞定位分析,為深入研究StPSKR 1和StPSKR 2基因在馬鈴薯生長發(fā)育和生物脅迫中的作用提供理論依據(jù)。結(jié)果發(fā)現(xiàn):(1)通過同源克隆與PCR擴(kuò)增獲得StPSKR 1和StPSKR 2的全長cDN段,并將其克隆到pGWB5-GFP載體;測序結(jié)果顯示這2個基因編碼的蛋白質(zhì)與數(shù)據(jù)庫給定的蛋白質(zhì)序列保持一致,表明成功克隆到StPSKR 1和StPSKR 2基因。(2)StPSKR 1位于馬鈴薯1號染色體上,cDNA全長3042 bp,編碼1013個氨基酸,預(yù)測蛋白相對分子質(zhì)量為112.16 kD,理論等電點(diǎn)6.27;StPSKR 2位于7號染色體,cDNA全長3135 bp,編碼1044個氨基酸,相對分子量為114.99 kD,理論等電點(diǎn)6.19。(3)生物信息學(xué)分析顯示,StPSKR1和StPSKR2都屬于跨膜蛋白。(4)亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,StPSKR1和StPSKR2均定位于細(xì)胞膜上。

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西北植物學(xué)報(bào)

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