摘要：克羅諾桿菌(Cronobacter)是一種急性細(xì)菌病原體,最初因與新生兒重癥監(jiān)護(hù)室爆發(fā)的幾起致死性疾病(腦膜炎,壞死性小腸結(jié)腸炎)相關(guān)而受到人們廣泛關(guān)注。目前Cronobacter PubMLST基因組和序列定義數(shù)據(jù)庫(pubmlst.org/cronobacter/)中已包含超過2400多株克羅諾桿菌分離菌株的序列信息,阪崎克羅諾桿菌1774株,丙二酸鹽陽性克羅諾桿菌295株是其中的優(yōu)勢(shì)菌種,這些菌株共分離自40多個(gè)國家和地區(qū)。通過將7個(gè)位點(diǎn)的多位點(diǎn)序列分型(7-loci multilocus sequence typing,7-lociMLST)方案應(yīng)用于2438株克諾羅菌株,共揭示了591種可定義的序列型(sequencetype,ST),其中ST4(334株)、ST1(280株)、ST7(78株)和ST13(67株)為主要序列型。7-lociMLST對(duì)于克羅諾桿菌的致病型分型鑒定有很大幫助,但由于MLST所針對(duì)的七個(gè)基因位點(diǎn)在基因組總量中占比較小,導(dǎo)致同一ST型中包含地理來源,分離時(shí)間,宿主等不相關(guān)的菌株,而對(duì)菌株溯源結(jié)果適得其反。為了解決這一問題,本研究進(jìn)一步采用基于直系同源基因簇的多位點(diǎn)序列分析方法(Clusters of Orthologous Genes MLST, cogMLST(1865-loci)),對(duì)PubMLST中240株已完成全基因組測(cè)序的菌株,包括阪崎克羅諾桿菌ST1(67株),ST4(95株),ST13(43株)和丙二酸鹽陽性克羅諾桿菌ST7(35株)進(jìn)行了全基因組序列分析。結(jié)果顯示,cogMLST可對(duì)ST型相同,但無相關(guān)性的菌株進(jìn)行進(jìn)一步分型,且不同聚類與菌株分離國家及來源之間存在一定相關(guān)性。這或許對(duì)于相同ST克羅諾桿菌屬菌株的全球溯源分析及食源性疾病監(jiān)測(cè)有較大幫助。