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溫度和藥劑脅迫下茶刺盲蝽內(nèi)參基因穩(wěn)定性分析

王政; 朱茜; 孟倩倩; 孫世偉; 高圣風(fēng); 劉愛(ài)勤 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院香料飲料研究所; 海南省熱帶香辛飲料作物遺傳改良與品質(zhì)調(diào)控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 萬(wàn)寧571533; 海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院; 海口570228
  • 茶刺盲蝽
  • 溫度
  • 藥劑
  • 內(nèi)參基因穩(wěn)定性
  • 實(shí)時(shí)熒光定量pcr

摘要:為篩選特定條件下實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)體系中能穩(wěn)定表達(dá)的茶刺盲蝽Helopeltis theivora內(nèi)參基因,從其轉(zhuǎn)錄組中篩選并克隆11個(gè)候選基因Actin、β-tubulin1、RPL13A、EF1α、RPS3A、GAPDH、18S RNA、G6PDH、EIF4A、TBP和UBQ,測(cè)定它們?cè)诓煌瑴囟燃八巹┟{迫下mRNA的表達(dá)水平,并通過(guò)geNorm、NormFinder、BestKeeper、Delta Ct和RefFinder軟件(算法)分析各基因的穩(wěn)定性。結(jié)果表明,11個(gè)候選基因引物均具有良好的特異性和擴(kuò)增效率(90.10%~96.87%)。溫度脅迫下,EIF4A有最小的平均變異度(mean variability,M)、穩(wěn)定值(stability value,SV)和幾何平均值,分別為0.200、0.096和2.060;RPS3A的平均標(biāo)準(zhǔn)偏差(average of standard deviation,STDEV)最小,為0.605;二者是表達(dá)最穩(wěn)定的基因。藥劑脅迫下,RPL13A的M值和STDEV最小,分別為0.123和0.660;RPS3A的SV、標(biāo)準(zhǔn)偏差(standard deviation,SD)和幾何平均值均最小,分別為0.063、0.336和1.189;二者是表達(dá)最穩(wěn)定的基因;Actin為最不穩(wěn)定基因。全樣品評(píng)價(jià)中,RPL13A(M值為0.282、幾何平均值為1.565)和RPS3A(SV為0.099、STDEV為0.614)的評(píng)價(jià)值同比最小,是表達(dá)最穩(wěn)定的基因;最不穩(wěn)定的基因?yàn)锳ctin、β-tubulin1和TBP。geNorm分析結(jié)果還顯示所有處理?xiàng)l件下最適內(nèi)參基因數(shù)目均為2個(gè)。表明EIF4A和RPS3A可作為茶刺盲蝽與溫度相關(guān)的抗性基因表達(dá)研究的內(nèi)參基因,RPS3A和RPL13A可作為該蟲抗藥基因表達(dá)研究的內(nèi)參基因。

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植物保護(hù)學(xué)報(bào)

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